Las bacterias del suelo desempeñan un papel fundamental en el proceso de descomposición de la materia orgánica, actuando como los principales agentes de transformación de residuos vegetales y animales muertos. Estas microorganismos secretan enzimas especializadas que rompen las estructuras complejas de cellulose, lignina y proteínas, convirtiéndolas en nutrientes bioavailable que las plantas pueden absorber.
Este mecanismo de descomposición tiene implicaciones críticas para el ciclo global del carbono. Las bacterias facilitan la mineralización de la Materia Orgánica, donde el carbono orgánico se divide en CO₂ que regresa a la atmósfera y sustancias inorgánicas como CO₃²-, que se incorporan a los depósitos sedimentarios. Se estima que alrededor del 70% del carbono total en los ecosistemas terrestres está almacenado en la biomasa microbiana y la materia orgánica del suelo, haciendo que este bioma represente uno de los mayores sumideros de carbono del planeta.
Además, la actividad bacteriana influye en la formación de humus y en la retención de agua en el suelo, aunque la eficiencia de este proceso varía según las condiciones ambientales y la composición de las comunidades microbianas locales.
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